Thoma měl podle policie v červnu 2010, tedy těsně před svým odvoláním, podepsat dodatek ke smlouvě o dodávce počítačového zařízení za více jak 37 milionů korun aniž by ji předložil ke schválení radě města. Společně primátorem policie obvinila také bývalého vedoucího odboru radnice.
„Statutárnímu městu České Budějovice tak způsobil škodu ve výši bezmála 5 000 000 korun. V rámci vyšetřování případu byl přibrán i soudní znalec z oboru ekonomiky, odvětví ceny a odhady výpočetní techniky, který potvrdil také toto nadhodnocení zakázky,“ vysvětlil mluvčí jihočeské policie Jiří Matzner.
Primátor odpoledne svolal tiskovou konferenci, na které oznámil, že kvůli trestnímu stíhání podá stížnost. Podle něj nebyl důvod žádat o schválení dodatku radou, protože smlouvu doporučil odbor informatiky, veřejných zakázek, i advokátní kancelář. Znění dodatku a ostatní materiály chce Thoma co nejdříve zveřejnit na internetových stránkách českobudějovického magistrátu.
Kriminalisté pracují na případu už od podzimu roku 2011. Spolupráce mezi městem a IT společností běží již několik let, přičemž veškeré smlouvy i dodatky byly dosud vždy projednány a schváleny radou města. „Mechanismus, jak v těchto případech postupovat, byl tedy oběma obviněným mužům tedy dobře znám,“ dodává Matzner.
Případ dozoruje plzeňské státní zastupitelství. Událost byla předána do jiného regionu kvůli možné podjatosti.
Rodák ze slovenské Nitry Juraj Thoma je primátorem Českých Budějovic přes šest let s dvouměsíční přestávkou v roce 2010, kdy ho z funkce sesadila ODS, jež byl tehdy členem. Thoma se ještě téhož roku stal lídrem hnutí Občané pro Budějovice a zvítězil v komunálních volbách.
