Zeman je znám svým odmítáním přijímání muslimských uprchlíků. Často poukazuje na to, že by mohli znamenat bezpečnostní hrozbu. Kvůli migraci také požaduje nasazení armády na ochranu českých hranic.
Schůzi Bezpečnostní rady státu avizoval původně premiér Bohuslav Sobotka (ČSSD) už na 30. září. Před poslanci v polovině září řekl, že se bezpečnostní rada bude mimo jiné zabývat otázkou nasazení armády, pokud nebudou kvůli migrační vlně stačit k ostraze česko-rakouských hranic policejní síly. Řekl také, že členové bezpečnostní rady se seznámí i s rozbory tajných služeb.