Neuspěla také žádná "zelená" uskupení - bývalá koaliční Strana zelených, neparlamentní Demokratická strana zelených a Zelení. I kdyby se hlasy pro všechny tři zelené počítaly dohromady, měly by jen 2,83 procenta hlasů.
Kritici lisabonské smlouvy - Suverenita, Libertas.cz a Strana svobodných občanů - získali dohromady 6,46 procenta hlasů. Naopak zastánci smlouvy - Evropská demokratická strana, SNK Evropští demokraté a "Starostové a nezávislí - vaše alternativa" - obdrželi 6,82 procenta.
Nejlepšího výsledku přitom dosáhla Suverenita se 4,26 procenta hlasů, ale ani to nestačilo, protože limit pro získání europoslance je pět procent.
Mezi kritiky lisabonské smlouvy, která má za cíl reformovat rozšířenou EU, patřil Vlastimil Tlustý, který se rozešel s ODS a v eurovolbách kandidoval stejně jako dosavadní europoslanec Vladimír Železný za Libertas.cz. Železný po volebním neúspěchu v EP končí.
Podobný postoj ke smlouvě měla dosavadní europoslankyně Jana Bobošíková, která neúspěšně usilovala o obhájení křesla za Suverenitu. Ke Straně svobodných občanů neskrýval v minulosti sympatie prezident Václav Klaus, známý kritik lisabonské smlouvy.
Křeslo neobhájila europoslankyně Jana Hybášková. Pokoušela se o to za Evropskou demokratickou stranu, jež naopak lisabonskou smlouvu propagovala.
Úspěšní nebyli ani senátoři Jaromír Štětina (zvolen za Stranu zelených) a Soňa Paukrtová (za Stranu pro otevřenou společnost), kteří kandidovali za "Starostové a nezávislí - vaše alternativa".
Z trojích zelených získala nejvíc hlasů Strana zelených, za niž kandidovala mimo jiné poslankyně Kateřina Jacques. Strana zelených dostala ale jen 2,06 procenta, což lze považovat za debakl. Volební zisk této strany, kterou podpořil exprezident Václav Havel, byl dokonce horší než neparlamentní Suverenity. Demokratická strana zelených s "odpadlicí" Strany zelených Olgou Zubovou obdržela 0,62 procenta hlasů. Zelení získali 0,15 procenta hlasů.
