Jak uvedl mediální server Mediaguru, Šafr se rozhodl k odchodu po rozhovoru s generální ředitelkou vydavatelství Ringier Axel Springer CZ Libuší Šmuclerovou, která mu nabídla dlouhodobou dovolenou.
"Je mi velice líto, že jsem ztratil Vaši podporu. Jistě chápete, že bez této podpory svoji funkci nemohu vykonávat,“ uvedl Pavel Šafr ve své rezignačním dopise.
Šafr se do čela Reflexu vrátil před rokem, kdy vystřídal Ivana Hamšíka, který vedl časopis v mezidobí.
Šafr vedl v roce 1993 Český deník, o rok později přestoupil na post šéfredaktora deníku Telegraf. Od roku 1997 až do roku 2000 byl šéfredaktorem Lidových novin, spolu s nimiž přešel v roce 1998 z vydavatelství Ringier ČR pod vydavatelství Mafra. V letech 2001 až 2006 pracoval jako šéfredaktor MF DNES, kde mimo jiné vedl projekt obsahové a grafické modernizace deníku.
Od roku 2007 do května 2008 působil jako zástupce generálního ředitele a ředitel redakcí ve vydavatelství Economia. V červenci 2008 se stal šéfredaktorem společenského týdeníku Reflex a 1. května 2011 přišel do vedení bulvárního deníku Blesk.
