Příkladem rychle se rozvíjející oblasti imunologie, významné pro lidské zdraví, je slizniční imunologie, a to zvláště studium efektů střevní mikroflóry na imunitní systém. Většina tělních povrchů, především pak sliznice tlustého střeva, je osídlena obrovským kvantem mikrobů. Normální střevní mikroflóra představuje komplexní ekosystém s ohromnou diverzitou, který se navíc jen těžko zkoumá v laboratoři: kolem 70 procent bakterií totiž nelze kultivovat.
Efekty mikroflóry a jejího složení na imunologické mechanismy se studují nejvýhodněji na unikátních modelech gnotobiotických (bezmikrobních) zvířat. Gnotobiologické pracoviště Mikrobiologického ústavu AV ČR založené před lety profesorem Šterzlem přineslo řadu významných výsledků především v oblasti vývoje imuinologie a vzniku některých chorob.
