Arcibiskup byl internován na utajených místech a živořil v nuceném vyhnanství až do jmenování kardinálem v lednu 1965. Představitelé režimu sice umožnili Beranovi odjet na slavnostní ceremoniál jeho jmenování do Vatikánu, zpět do vlasti jej už ale nepustili.
Památku Josefa Berana, který je pohřben jako jediný kardinál mezi papeži v kryptě vatikánské baziliky svatého Petra, připomene seminář Odchody a návraty ve Spáleném Poříčí na Plzeňsku. Po nedělní mši následuje v pondělí cyklus přednášek věnovaný například tomu, jak „případ Beran“ ovlivnil jednání mezi státem a církví, perzekuci katolické církve v minulém režimu či právním aspektům probíhajícího blahořečení Josefa Berana.