Jan Sobotka publikoval v 90. letech zejména v magazínu Rock & Pop, kde působil také jako editor. V dalších dekádách byl mimo jiné kmenovým přispěvatelem elektronického časopisu Crossroads, zaměřeného na bluesovou a jazzovou hudbu, nebo kulturního magazínu UNI.
Byl také častým hostem dylanologických klubových diskusí či odborným konzultantem knižních nakladatelství. Výraznou stopu zanechal i jako spoluorganizátor každoročních Dylan Days, hudebních i odborných oslav narozenin Boba Dylana.
Nepřeslechnutelná byla i jeho muzikantská činnost. Několikrát na českých turné doprovázel amerického hudebníka Davida Evanse, vystupoval sólově i v rámci projektu Broken Harp s dalšími domácími hudebníky.