Podle důvěryhodných zdrojů patří mezi oponenty zlevnění i Češi, kteří upozorňují, že by Brusel připravil patentové úřady o značný příjem. Obavy o finanční soběstačnost ovšem nejsou jediným důvodem, proč členské státy nejsou z nápadu Evropské komise příliš nadšeny. Politici se obávají, že při razantním poklesu poplatků za patenty budou evropské úřady zaplaveny nekvalitními žádostmi z celého světa, přičemž by jim kvůli tíživé finanční situaci nezbylo nic jiného, než je přijmout.
Kromě ceny patentů unii trápí i jejich roztříštěnost, což je výrazná konkurenční nevýhoda ve srovnání se Spojenými státy či Japonskem. Problémem je také finanční náročnost překladů do všech jazyků EU. Náklady na patent v unii jsou zhruba jedenáctkrát vyšší než ve Spojených státech, a dokonce třináctkrát vyšší než v Japonsku.
Velkou roli však při jednáních hraje také politika. O jednotném patentu neradi slyší především Němci. V Německu je totiž registrována zhruba polovina evropských vynálezů, což představuje nemalý zdroj příjmů.