Na ÚS by se mohl kvůli smlouvě obrátit jeden z jejích největších kritiků, prezident Václav Klaus. Jeho poradce Ladislav Jakl řekl, že mu to doporučí. Sám Klaus očekává, že se na ÚS znovu někdo ze senátorů či poslanců obrátí. Rychetský upozornil, že středeční nález ÚS se týkal nejspornějších a nejcitlivějších ustanovení smlouvy, která má reformovat instituce EU po jejím rozšíření. ÚS přitom neshledal rozpor mezi smlouvou a českým ústavním pořádkem, takže její ratifikace v Česku může pokračovat. Není ale jasné, kdy obě parlamentní komory její schvalování ukončí. Snahu schválit ji do konce roku označil premiér Mirek Topolánek (ODS) za riskantní. Naopak ČSSD, zelení a lidovci kvůli tomu chtějí svolat mimořádné jednání sněmovny.
ODS se bojí o Benešovy dekrety Místopředseda ODS Petr Bendl je přesvědčen, že smlouva by mohla prolomit platnost takzvaných Benešových dekretů. O případném podání poslanců ODS k Ústavnímu soudu by podle něj měli zákonodárci ještě diskutovat.
Poradce prezidenta Ladislav Jakl se vyjádřil k úvahám místopředsedy zelených Ondřeje Lišky, že prezident nadužívá práva, která mu dává ústava, nerespektuje vládu jako tvůrce zahraniční politiky, a že je proto třeba se zamýšlet nad tím, jak prezidenta za určitých okolností odvolat. Klaus je podle svého poradce stoprocentně loajální k České republice.