Fujimoriho vláda padla v roce 2000 kvůli korupčnímu skandálu. Exprezident vládl celkem deset let. Několik let žil v exilu v Japonsku.
V roce 2005 Fujimori oznámil svůj úmysl opět kandidovat ve volbách a odletěl do Chile, která s Peru sousedí. Zde ho na základě mezinárodního zatykače zatkla místní policie.
Peruánská prokuratura obvinila Fujimoriho z 12 zločinů. Figurují mezi nimi zneužití moci, zpronevěra nebo schvalování činnosti polovojenských eskader smrti.
