Jan Hajda byl senátorem od roku 2006 a zastupitelem v obci Pavlov od roku 1994. Vystudoval provozně ekonomickou fakultu Vysokou školu zemědělskou v Brně. Poté pracoval jako ekonom v JZD Pavlov. Od roku 1988 byl předsedou Zemědělského družstva Sedlec na Břeclavsku a téhož roku se stal šéfem Okresní agrární komory v Břeclavi.
Do ČSSD vstoupil po roce 1989, v minulosti byl členem KSČ. Do Senátu kandidoval již v roce 2000, ale skončil až třetí. V roce 2006 se stal senátorem, když v prvním kole porazil občanského demokrata Milana Blažka.
Ve druhém kole svou nejsilnější pozici potvrdil a mandát člena horní komory získal díky 57,71% všech platných hlasů. V Senátu byl předsedou Výboru pro hospodářství, zemědělství a dopravu. Od roku 2014 působil v týmu poradců bývalého premiéra Bohuslava Sobotky jako poradce pro oblast životního prostředí, energetiky, místního rozvoje a zemědělství. Působil i ve Stálé komisi Senátu pro rozvoj venkova.