V roce 1986 se jí podařilo získat popularitu mezi širokými vrstvami obyvatel, kteří jí ve volbách, v nichž kandidovala za opozici, dali o 1,8 milionu hlasů víc než jejímu soupeři Ferdinandu Marcosovi.
Vítězstvím v prezidentských volbách ukončila 20 let trvající Marcosův represivní režim a prezidentský úřad poté zastávala do roku 1992. Během těchto šesti let se jí podařilo na Filipínách uhájit demokracii a odvrátit sedm pokusů o státní převrat.
Coby prezidentka se ale potýkala s příliš vysokými očekáváními veřejnosti.
Jejímu programu přerozdělování půdy se nepodařilo ukončit dominanci pozemky vlastnící elity včetně vlastní rodiny. Deziluzi vyvolaly také málo rozhodné pokusy o sociální a ekonomické reformy.
Přesto zůstala obrýlená, usměvavá dáma v typických žlutých šatech na Filipínách oblíbená a obyvatelé jí familiárně říkali Tita (tetička) Cory.
V loňském roce lékaři Aquinové zjistili rakovinu tlustého střeva, která se rozšířila i na další orgány. Poslední měsíc strávila v manilské nemocnici, kde také v pátek zemřela.