Řízení navrhl prezident úřadu František Dohnal. Bránil se tak nařčení z nesrovnalostí v hospodaření úřadu, z nichž ho viní členové kolegia. Právě Dohnal spolu se dvěma soudci Nejvyššího soudu Pavlem Kučerou a Karlem Haschem v kárné komoře zasedl.
Na základě informací z usnesení schváleného kolegiem se začal kauzou NKÚ zabývat i kontrolní výbor Poslanecké sněmovny. Jeho předseda Vladimír Koníček (KSČM) podal návrh na zahájení kárného řízení s Dohnalem. Šéf NKÚ čelí také trestnímu oznámení pro údajné porušování povinností při správě cizího majetku.
Dohnal obvinění odmítá a chce se proti němu bránit všemi prostředky. Kromě návrhu na kárné řízení také podal trestní oznámení na pět poslanců kontrolního výboru.
Úřad vedený Dohnalem údajně opakovaně upravoval rozsah zakázky tak, aby její hodnota klesla pod dva miliony korun. Poslanci Dohnala kritizují také za to, že si nechal od úřadu platit nájem dvou bytů, ačkoli má nárok jen na jeden. Dohnal již dříve oznámil, že se z bytu vystěhuje.
