Eccleston se proslavil v oblíbeném televizním seriálu Doctor Who, píší internetové stránky BBC News. Chystaný film BBC s názvem Lennon Naked zachytí tragickou smrt manažera Beatles Briana Epsteina, Lennonův rozvíjející se vztah s Yoko Ono a jeho odchod ze slavné čtveřice. Devadesátiminutové drama skončí rokem 1971, kdy Lennon vydal desku Imagine a společně s Yoko Ono se přestěhovali do New Yorku.
Christopher Eccleston na sebe poprvé upozornil ve filmu Mělký hrob režiséra Dannyho Boylea z roku 1994. Poté se proslavil v pokračování klasického anglického sci-fi seriálu z let 1963 - 1989 s názvem Doctor Who, které vzniklo v roce 2005. Hrál také ve filmech Královna Alžběta a Ti druzí.
