Tehdy vláda přiklepla Unipetrol za jedenáct miliard korun Agrofertu, společnosti reprezentované Andrejem Babišem. Bylo to značně překvapivé a navíc v rozporu s pravidly soutěže. Konkurenční zájemce nabízel za podnik o čtyři miliardy korun více.
Když pak Babiš nakonec ani na vyzvání nové Špidlovy vlády za Unipetrol nezaplatil, stát si ho ponechal a pustil se do dalšího pokusu o privatizaci. Tendr vyhrála polská firma PKN Orlen v dubnu 2004. Případem Unipetrol se pak zabývala krakovská prokuratura. Měla přitom zájem vyslechnout významné tuzemské politiky - kteří vydláždili cestu k vítězství PKN Orlen tím, že bez ohledu na pravidla soutěže vyřadili všechny další seriózní zájemce. Hlavním podezřelým byl pro polské vyšetřovatele Stanislav Gross, který byl s Babišem v pravidelném kontaktu.