Naopak čtyřprocentní snížení dotací pro velké farmy, které ročně pobírají na přímých platbách více než tři sta tisíc eur, se tuzemského zemědělství bude dotýkat více. Tyto farmy totiž ovládají přes devadesát procent české zemědělské produkce. Podle prezidenta Agrární komory ČR Jana Veleby by se ale velké farmy s krácením dotací měly vzhledem ke své ekonomické síle vypořádat snáze než menší družstva.
Česká republika však přesto konečný dokument nepodpořila a bude se snažit v rámci svého blížícího se předsednictví Evropské unie některé parametry dodatečně změnit.