Sonda se měla dostat do vesmíru na palubě nešťastného raketoplánu Challenger v květnu 1986. Po jeho havárii v lednu téhož roku si ale místo na palubě jiného stroje našla až v roce 1990.
Ihned nastoupila na dráhu nastavenou tak, aby ji gravitace Jupitera vystřelila pryč z roviny ekliptiky - roviny, ve které Země obíhá kolem Slunce. Díky tomu si mohla prohlédnout naši hvězdu i z velmi nezvyklých úhlů, které do té doby vědě zůstávaly skryty - včetně obou pólů Slunce.
Sonda zkoumala především sluneční vítr - proud částic ze Slunce. Prolétla také ocasy tří komet a objevila nečekané množství částic hélia přilétajících k nám z hlubokého vesmíru. To změnilo odhady množství hmoty ve vesmíru.
Příčinou odstávky je promrznutí sondy. Velká část radioaktivního materiálu v palivových článcích se už rozpadla, a tak Ulysses nemá dost energie. Stejný osud sondě hrozil loni. Nakonec se jí podařilo udržet v provozu, i když její vědecké možnosti byly omezeny. Poslední spojení se sondou se uskutečnilo včera večer.