Čtvrtek 2. prosince 2021, svátek má Blanka
  • schránka
  • Přihlásit Můj účet

Lidovky.cz

Místo zkumavky obrazce v počítači

Česko

Pokusy s bílkovinami, základními stavebními kameny lidského těla, se odehrávají ve virtuálním prostředí. Zkumavky zcela nahrazuje počítač. Jak experimenty, za které docent Pavel Jungwirth dostal nedávno v Británii Spiersovu cenu, probíhají?

Tým docenta Pavla Jungwirtha z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR sestaví počítačový model vody, iontů solí a bílkoviny. Volba modelu je ovlivněna dosavadním poznáním, jak na sebe ionty a atomy na povrchu bílkoviny ve vodě působí.

Model je tedy zjednodušený, ale jakmile vědci systém vymezí určitými kritérii, nechají ho vyvíjet samostatně podle newtonovských rovnic. Spontánně se tak vytvářejí struktury, které jsou energeticky výhodné. Jedním z indikátorů o správnosti modelu je jeho stabilita. Pokud se při drobné změně parametrů bude systém vyvíjet úplně jinak než v předchozím pokusu, pak je model nespolehlivý.

Nyní dokáže tým docenta Jungwirtha monitorovat pohyby bílkovin a iontů ve vodě s časovým rozlišením pouhé femtosekundy, tj. 10-15 sekundy. Taková „momentka“ už na úrovni atomů zachytí objekty v klidu. Biochemiky ovšem zajímají především pomalejší procesy jako uspořádávání bílkovin a ty trvají milisekundy až sekundu. Vědci je ale zatím dokáží napodobit jen po dobu několik mikrosekund. Pro představu, v počítačovém čase trvá taková simulace týdny až měsíce.

Autor:

ANALÝZA: Případ Kenosha. Média si napsala vlastní verzi

Premium Půlka Ameriky si udělala z Kylea Rittenhouse, jenž zastřelil dva lidi, vzorovou karikaturu bílého rasisty s puškou, a...

Pět nejčastějších chyb, které Češi dělají v penzijním spoření

Premium Ve starém „penzijku“ si na důchod spoří více než tři miliony Čechů a v nových fondech už přes 1,3 milionu lidí. Stát...

Strach se do lidí pouští jako jed. Horší než covid je hysterie, říká herec Dušek

Premium Je hercem, režisérem, scenáristou, moderátorem. Renesančního ducha zřejmě Jaroslav Dušek zdědil po svém rodu s modrou...