Hughes také napsal a produkoval divácky úspěšné rodinné komedie Sám doma, díky nimž se stal hvězdou Macaulay Culkin. V devadesátých letech se zaměřil na scénáře rodinných komedií, mezi než patří například remake snímku 101 dalmatinů či jiný psí příběh Beethoven, který napsal pod pseudonymem Edmon Dantes.
Jako herce diváci viděli Hughese například ve filmech Broken Vessels či Volný den Ferrise Buellera. Poslední léta žil John Hughes jako farmář ve státě Illinois. Zemřel při procházce po Manhattanu.
