Pacovský se narodil 22. července 1928 v Praze. Po promoci v roce 1952 nastoupil na III. interní kliniku VFN, kde až do nedávna pracoval.
Profesorem vnitřního lékařství byl jmenován k 1. lednu 1969. Byl členem Akademie věd. V letech 1970 až 1990 působil jako přednosta III. interní kliniky tehdejší Fakulty všeobecného lékařství (FVL) UK. Od roku 1985 byl děkanem FVL UK, od roku 1980 byl pět let prorektorem UK v Praze.
Pacovský se zasloužil o vznik gerontologie a geriatrie jako samostatného oboru, o zavedení vysokoškolského studia ošetřovatelství v Česku a o vznik takzvaných univerzit třetího věku. Podle svých kolegů byl Pacovský především internistou, napsal moderní učebnici vnitřního lékařství. V roce 2003 odešel do důchodu. Na kliniku však docházel ještě poměrně nedávno každý týden.
Rozloučení se uskuteční v rodinném kruhu.