Vedle výzvy neziskových organizací dostal premiér i dopis s podobným požadavkem z Ústeckého kraje. Důvodem mají být mimo jiné Rafajovy kauzy z poslední doby. V uplynulém týdnu se premiér k požadavku odmítl vyjádřit s tím, že se s materiály seznámí a vládní strany k tomu zaujmou „nějaké stanovisko“. Uvedl také, že výzvách zatím nejednal s prezidentem, schůzku s ním v nejbližší době sjednanou nemá. Podle vyjádření ÚOHS k odvolání není důvod, protože Rafaj nebyl z ničeho obviněn.
Servery IHNED.cz a Aktuálně.cz v uplynulém týdnu napsaly, že se policie zajímá o Rafajovy schůzky s hejtmanem Jiřím Čunkem. Schůzky daly do souvislosti mimo jiné s rozhodováním o soutěži na projekt kontroverzní nové zlínské nemocnice za osm miliard, který Čunek tvrdě prosazuje. Čunek schůzky přiznal, podle něj společně řešili jeho „senátní aktivity“. Podobně mluví i Rafaj.
Zastupitelstvo Ústeckého kraje k odvolání Rafaje vyzvalo vládu na konci června. Žádá i o reformu rozhodovacích mechanismů úřadu. Rozhodování ÚOHS ohledně veřejných zakázek podle náměstka hejtmana pro dopravu Jaroslava Komínka není transparentní a má znaky svévole.
Loni v březnu policie zasahovala na antimonopolním úřadu kvůli tendru na výběr mýta. Letos v červnu pak server Aktuálně.cz upozornil na to, že Rafaj užívá byty napsané na firmu vlivného zákulisního hráče ČSSD Alexandra Čuby. Záloha 3,5 milionu na byt v Brně byla ale zaplacena z Rafajova konta.
Předsedou Úřadu pro ochranu hospodářské soutěže je Rafaj od 9. července 2009, pro druhé funkční období prezident bývalého poslance sociální demokracie jmenoval v červnu 2015. Za necelý rok tak Rafajovy vyprší druhý šestiletý mandát. Zákon o antimonopolním úřadu uvádí, že prezident může odvolat předsedu úřadu na návrh vlády. Odvolat ho lze jen, pokud nevykonává funkci po dobu delší než šest měsíců, nebo narušuje závažným způsobem důstojnost své funkce anebo nezávislost a nestrannost úřadu.