Markovičová byla během třináctileté vlády svého muže jeho věrným spojencem a měla značnou moc a vliv na dění ve státě. V únoru 2003, po pádu svého chotě v říjnu 2000, uprchla před stíháním za zneužití funkce a korupci do Ruska, kde i se synem Markem získali v roce 2008 politický azyl.
Slobodan Milošević zemřel na selhání srdce 11. března 2006 v cele mezinárodního tribunálu v Haagu ještě před ukončením procesu, ve kterém čelil obžalobě z válečných zločinů a ze zločinů proti lidskosti v bývalé Jugoslávii. Jeho žena a syn se pohřbu v Srbsku ze strachu před zatčením nezúčastnili.